设计思想
面向对象的设计思想。

优点
模块化，各模块代码非常独立，最小的核心只有8k，最大的优点是可选择使用哪些模块，用的时候只导入使用的模块即可，完整的也不到180k（没有压缩），压缩后不到70k。
语法的简洁，直观。
特效（Effects）：这一点比jQuery稍强，现在也正在开发Mootools UI（这应该是Ajax框架开发的一个趋势）。
代码写的优美，易阅读和修改。
文档的完整（最新的1.2beta的文档比以前更详细）。
活跃的社区：官网(http://forum.mootools.net/)，还有一个IRC。
性能：见：http://mootools.net/slickspeed/

缺点
修改了低层的一些类：如Array, String等，这也是设计思想的不同。
在DOM和CSS Selector上不如jQuery强大。